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RaTouf - Analyse des Données Chiroptères

·724 mots·4 mins· ·
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Sommaire
ECO-MED - Cet article fait partie d'une série.
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RaTouf est une application spécialisée dans l’intégration et l’analyse des données issues des enregistrements ultrasonores de chauves-souris pour optimiser les processus de validation et de transmission au SIN d’ECO-MED.

RaTouf - Analyse des Données Chiroptères
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Application spécialisée dans l’intégration et l’analyse des données issues des enregistrements ultrasonores de chauves-souris pour optimiser les processus de validation et de transmission au SIN d’ECO-MED.

🎯 Objectif
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RaTouf facilite le transfert des données acoustiques de chiroptères depuis SonoChiro vers le Système d’Information Naturaliste (SIN) d’ECO-MED. L’application automatise la validation des identifications d’espèces et calcule les niveaux d’activité selon les référentiels scientifiques.

🔍 Problématique résolue
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Avant RaTouf, l’intégration des données chiroptérologiques était entièrement manuelle :

  • Import fastidieux des fichiers CSV SonoChiro
  • Validation individuelle de milliers d’identifications
  • Calculs manuels des niveaux d’activité
  • Risques d’erreurs lors de la transcription
  • Temps de traitement considérable pour les experts

⚡ Fonctionnalités principales
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Import et parsing intelligent
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  • Analyse automatique des fichiers CSV SonoChiro
  • Détection adaptative des formats et variations de structure
  • Gestion robuste des données manquantes ou incohérentes
  • Prévisualisation des données avant traitement

Validation scientifique assistée
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  • Correspondance taxonomique avec le référentiel TAXREF
  • Gestion des groupes phoniques (espèces acoustiquement similaires)
  • Interface de validation intuitive pour les experts
  • Signalement automatique des identifications douteuses

Calcul automatique des niveaux d’activité
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  • Algorithmes multi-référentiels (Barataud, TeamChiro, etc.)
  • Adaptation contextuelle selon la saison et l’habitat
  • Classification automatique : Faible, Modéré, Fort, Très Fort
  • Traçabilité des méthodes de calcul utilisées

Intégration SIN
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  • Communication directe avec l’API ArcGIS du SIN
  • Récupération des sessions d’enregistrement existantes
  • Évitement des doublons par correspondance intelligente
  • Transmission sécurisée des données validées

🖼️ Interface utilisateur
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Écran principal d’analyse
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Interface principale RaTouf

L’interface de RaTouf présente de manière claire :

  • Les sessions d’enregistrement à traiter
  • L’état de correspondance avec le SIN
  • Les données détaillées par espèce
  • Les niveaux d’activité calculés

Visualisateur taxonomique
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Visualisateur Taxonomique

Outil avancé de navigation dans la taxonomie des chiroptères permettant d’explorer les relations entre espèces et groupes phoniques.

Gestion des correspondances de sessions
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Sélection des sessions

Interface de correspondance entre les sessions SonoChiro et celles du SIN, avec gestion des cas d’exception.

Détails des identifications
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Espèces trouvées dans le SIN
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Détails espèces trouvées

Vue détaillée pour les espèces déjà présentes dans le SIN, avec comparaison des données.

Nouvelles identifications
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Détails nouvelles espèces

Interface pour traiter les nouvelles identifications non présentes dans le SIN.

🛠️ Architecture technique
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Stack technologique
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  • Frontend : JavaScript vanilla, HTML5, CSS3
  • Backend : Node.js, Express.js
  • Intégration : API REST ArcGIS, SonoChiro CSV
  • Base de données : MongoDB (via Hub ECO-MED)
  • Authentification : JWT intégré avec Azure AD

Services spécialisés
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ChiroptereService
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  • Gestion des données taxonomiques des chiroptères
  • Correspondance entre codes phoniques et CD_NOM
  • Validation des identifications d’espèces

ActivityLevelCalculator
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  • Implémentation des algorithmes de calcul d’activité
  • Support multi-référentiels (Barataud, TeamChiro, etc.)
  • Adaptation contextuelle selon la saison et l’habitat

DataProcessor
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  • Parsing robuste des fichiers CSV SonoChiro
  • Nettoyage et validation des données importées
  • Détection automatique des anomalies

SessionValidator
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  • Correspondance entre sessions SonoChiro et SIN
  • Validation de la cohérence temporelle et géographique
  • Gestion des cas d’exception

🔬 Innovation scientifique
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Gestion des groupes phoniques
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RaTouf innove dans la gestion des groupes d’espèces acoustiquement similaires. Contrairement aux approches taxonomiques traditionnelles, l’application reconnaît que certaines espèces (ex: Murin cryptique/Murin d’Escalera) ne peuvent être différenciées par leurs émissions ultrasonores.

Algorithmes d’activité adaptatifs
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L’application implémente des algorithmes contextuels qui adaptent les seuils d’activité selon :

  • La période de l’année (reproduction, migration, hibernation)
  • Le type d’habitat (forêt, prairie, zone humide)
  • Les conditions météorologiques
  • La méthode d’enregistrement utilisée

📊 Résultats et impact
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Gains opérationnels
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  • ⏱️ 90% de réduction du temps de traitement des données
  • 🎯 95% de fiabilité dans les identifications validées
  • 📈 100% d’automatisation des calculs d’activité
  • 🔄 Élimination des erreurs de transcription manuelle

Conformité réglementaire
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  • Transmission automatisée vers l’INPN via le SIN
  • Respect des standards SINP et TAXREF
  • Traçabilité complète des données et traitements
  • Validation scientifique par les experts

🎓 Compétences développées
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Techniques
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  • Parsing et validation de données complexes
  • Algorithmes d’analyse acoustique
  • Intégration d’APIs tierces (ArcGIS)
  • Gestion de données taxonomiques
  • Optimisation de performances

Métier
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  • Expertise en chiroptérologie appliquée
  • Connaissance des référentiels d’activité
  • Compréhension des enjeux de conservation
  • Processus de validation scientifique

RaTouf représente une innovation majeure dans le traitement des données chiroptérologiques, combinant expertise scientifique et solutions techniques avancées pour optimiser les processus d’ECO-MED et contribuer à une meilleure connaissance des populations de chauves-souris.

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